柯炳生认为，加强农业创新发展，对于确保实现全面建成小康社会的“十三五”目标极为重要。他说，我国农业发展的主要矛盾，仍然是资源短缺和需求不断增长的矛盾，是产能不足而不是产能过剩。我国粮食生产12年连增，成绩来之不易，但仍然落后于需求增长。近年来我国农产品进口持续增长。2015年，我国净进口大豆8156万吨，仅此一项，如果靠国内生产，就要占用全国耕地面积的1/3。此外，在谷物、棉花、植物油、食糖等方面也有大量进口。至于目前粮棉个别产品的库存较高，是若干特殊原因造成的暂时性现象。

　　此外，柯炳生认为，我国的农业已经进入了一个新阶段，面临的最大问题是劳动力成本刚性增加。“十二五”期间，农民工收入平均增长12.7%，这直接拉动了农业劳动力的成本。在劳动力价格大幅提高时，如果创新跟不上，就会落入“中等陷阱”。这种端倪需高度警惕。所以要不断强化政策创新、组织创新和科技创新，大力推进现代农业建设，转变农业发展方式。政策创新方面，主要是创新农业补贴政策，把通过国家收购方式的补贴和各种直补，整合为对耕地面积的补贴。这既符合“市场资源配置”精神，也符合世贸组织的规定，同时还有利于保护土地资源。