国家设施农业工程技术研究中心在2011年1月由国家科技部批准组建，依托单位为上海农科院上海都市绿色工程有限公司和同济大学。中心围绕“设施农业装备标准化设计、制造、安装和新型材料”、“设施农业设计、建造和管理中的节能及新能源应用”、“设施农业绿色高效生产技术及专用品种培育”、“设施农业中的环境控制技术”四大方向开展产学研合作研究，已具有一定的国际影响力。上海都市绿色工程有限公司通过集成创新和自主创新，自控玻璃温室、屋顶全开型温室的国内市场占有率超过了50%，具有自主知识产权的产品已实现批量出口。

　　国家家禽工程技术研究中心

　　国家家禽工程技术研究中心于1996年经国家科技部批准组建。依托上海市农业科学院和上海家禽育种有限公司。主要研究领域包括家禽新品种选育、营养与饲料、禽检测与防控、环境控制及资源利用、禽产品安全以及禽舍信息化技术研究。目标是针对家禽产业发展需要，开展共性、关键性工程化技术及其应用开发研究。家禽中心每年定期举办各类型技术培训活动，与国内多家大学及科研机构建立长期科研协作和学术交流等合作关系。与美国Hy-line、NOVA-TECH、德国Vaxxinova等3家国外企业，9家国内企业签署技术开发和服务合作协议。

　　上海市农业生物基因中心

　　上海市农业生物基因中心成立于2002年，是全国农业科研院所综合实力百强所。主要开展农业基因资源的收集保存、研究评价，已获得3个上海市科技进步一等奖，1个国家技术发明二等奖。节水抗旱稻既具有水稻的高产优质特性、又具有旱稻的节水抗旱特性。在轻度干旱条件下能保证产量稳定，在干旱较重时能获得一定程度的产量，避免了一般水稻遇旱则严重减产或绝收的情况。节水抗旱稻在栽培上，简单易行，投入低，节能环保。中心已培育了适应中国不同生态区域的节水抗旱稻系列品种。在越南、缅甸、尼日利亚等国表现不俗，已展示良好的应用前景。

　　国家食用菌工程技术研究中心

　　国家食用菌工程技术研究中心由国家科技部批准组建。中心发展成为我国食用菌行业的领军者和技术创新的源泉为目标。主要研究方向:食用菌资源与种质创新、食用菌生理与设施栽培、食用菌加工技术与发酵工程、食用菌产品质量监控检测、食用菌产业信息。中心拥有新品种、新技术示范转化基地35个，与国内食用菌科研院所、企业和食用菌生产基地建立了广泛的合作关系。近五年来，中心获得中华人民共和国国际科学技术合作奖1项，国家友谊奖1项，国家科技进步奖二等奖1项，上海市科技进步奖一等奖1项，上海市科学技术进步奖三等奖2项。