在禁止领域，两个负面清单规定完全相同。主要包括两项：一是禁止投资中国稀有和特有的珍贵优良品种的研发、养殖、种植以及相关繁殖材料的生产（包括种植业、畜牧业、水产业的优良基因）；二是禁止投资农作物、种畜禽、水产苗种转基因品种选育及其转基因种子（苗）生产。种植业领域的稻、大豆现阶段仍属禁止外商投资领域。

　　在限制领域，两个负面清单对外商投资股比要求不同，与2017年版《外商投资准入特别管理措施（外商投资准入负面清单）》和《自由贸易试验区外商投资准入特别管理措施（负面清单）（2017年版）》相比，此次负面清单进行了调整：“2018全国版”将外商投资种业的作物限制范围由“农作物”缩减为“小麦、玉米”，要求中方控股（中方持股比例不低于51%）。“2018自贸试验区版”将外商投资种业的作物限制范围由“农作物”缩减为“小麦、玉米”，要求中方持股比例不低于34%。

　　根据《种子法》和外商投资等有关法律法规的规定，外商投资玉米、小麦种业领域，须进行准入许可；稻、大豆种业禁止外商投资，暂不受理申请。同时，外商投资种业企业从事种子生产经营活动，无论是玉米、小麦还是其他作物，皆需办理《农作物种子生产经营许可证》，许可证申请由省级农业主管部门受理审核，报农业农村部核发。